El área de Pesquerías centra su investigación en: i) Evaluación y Prospección de Recursos Pesqueros, ii) Pesquerías sotenibles: reducción de descartes y nuevos productos de la pesca y iii) Ecología pesquera y dinámica de poblaciones marinas explotadas.
El área de Medio Marino y Contaminación Ambiental se centra en: i) Dinámica marina y procesos oceanográficos, ii) Oceanografía biológica, ecología del plancton, iii) Interacción océano-clima, iv) Monitoreo y análisis del impacto de la contaminación marina en organismos acuáticos.
El área de Acuicultura centra su investigación en: i) Técnicas de producción a escala preindustrial de peces y moluscos y ii) Diversificación de especies en acuicultura